将大鼠基因的功能对号入座
将大鼠基因的功能“对号入座”
本报讯(记者孙国根)国家“千人计划”入选者、复旦大学药学院石乐明教授率领博士研究生郁颖、博士后赵琛等,与美国食品和药物管理局国家毒理学研究中心、洛马林达大学等合作,经两年多艰辛攻关,成功绘制出涵盖11种器官和4个发育阶段的大鼠基因功能图谱,该成果对药物安全性评价和个性化医疗有重要意义。相关研究论文近日发表在《自然·通讯》杂志上。 据介绍,跟小鼠比较,大鼠的生物表现行为更贴近人类,因而更适合进行药物安全性、代谢机理、潜在的药物风险和化学毒性评估等研究。但目前科学界对大鼠的遗传密码、基因图谱等研究仍不完整,对大鼠的基因功能等缺乏科学、权威的解释,这些因素直接影响了科研的进一步开展。 石乐明课题组和合作者,运用RNA测序技术,用了两年多时间,对一种专门广泛应用于药物安全性评价研究、命名为“Fischer344”大鼠的幼年、青春期、成年及老年的基因进行测试,该测试涵盖11种器官的320个样本,最终绘制出目前世界上最完整的大鼠基因功能图谱。为证明该图谱的可靠性,石乐明课题组专门验证了美国一著名专业基因功能数据库(AceView)以往所注释的众多有生物功能的基因,并绘制出40064个基因和65167种有生物功能的基因变种的表达谱,其中包括31909种选择性剪接转录变异体和2367种非编码基因。 研究发现,大鼠中存在着大量人类以前并未认识到的功能基因,组织与组织之间所表达的基因数量不同,不同年龄段基因数量不同,雌雄之间组织器官表达的基因数量和功能也不同,同时发现有些基因会根据不同情况发挥不同作用,如有许多基因只在某些特定的组织器官、年龄段上发挥作用。掌握这些信息,有助于科学家根据不同器官、不同年龄段以及不同性别等基因差异,深入研究药物,更有助于推动个性化给药方式。
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